Заповедник "Тунгусский" является природоохранной территорией федерального значения, где его сотрудниками осуществляются следующие задачи:
- осуществление охраны природных территорий в целях сохранения биологического разнообразия и поддержания в естественном состоянии охраняемых природных комплексов и объектов;
- организация и проведение научных исследований, включая ведение Летописи природы;
- осуществление экологического мониторинга;
- экологическое просвещение населения (природоохранные акции, организация экологических лагерей, экологический туризм);
- участие в государственной экологической экспертизе проектов и схем размещения хозяйственных и иных объектов.